- LCMBA
Sébastien Fiorucci, Jérôme Golebiowski, Serge Antonczak
LCMBA, UMR CNRS – UNSA 6001, équipe modélisation moléculaire.
- Simulations de dynamique moléculaire avec le logiciel Amber de système protéiques
(récepteurs olfactifs et OBP) impliqués dans les premières étapes
moléculaire de l’olfaction.
- Simulation de docking avec Ptools/Attract. Prédiction des structures
de complexes ligand/récepteur.
- INRA Sophia-Antipolis
Etienne G.J. Danchin, Amandine Campan,
Détection de transferts horizontaux de gènes (organismes non métazoaires / nématodes). Projets MIE et NEMATARGETS.
Comparer chaque séquence avec toutes les séquences du jeu (« BLAST tout contre tout »), puis créer les groupes de protéines orthologues
Use case description
- IGS Marseille
Exécuter des tâches pour faire de séquencage de protéines et molécules, en utilisant blast, muscle et shrimp.
- PME K-Epsilon
Yann Roux
Execution parallèle de Simulation en Mecanique des Fluides, Nautisme
- IPMC, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire,
Romain GAUTIER, Molecular Dynamics, Utilisation de Gromacs
- INRIA Sophia Antipolis :
- MAESTRO, Soumission de simulations d’analyse de performances de
stockage en pair à pair, basé sur Matlab. Simulation de méchanismes de
coordination de réseaux de capteurs
- ODYSSEE, Simulations bioinformatiques basées sur OpenMP:
- Analyse de mouvements par l’utilisation d’une architecture basée sur le cerveau d’un primate.
- Simulations Monte Carlo
- ASCLEPIOS, Calcul de volumes à partir d’une pile d’images
- I3S-CNRS- UNSA, CREATIVE, évaluation d’algorithmes de traitement d’image avec Matlab
